Proslulé a pověstné Nindža-želvy: Raphael, Michelangelo, Leonardo a Donatello byly kdysi čtyři docela obyčejné želvy, které žily v newyorském kanále. Zde se dostaly do styku s radioaktivním bahnem a následkem toho se změnily v bytosti podobné lidem. A tehdy začalo jejich velké dobrodružství a věčný souboj s největším nepřítelem Shredderem a jeho pomocníky Rockym a Bobem, kteří bez ustání usilují o zničení celého lidstva. Podaří se Nindža-želvám překazit jim tyto nebezpečné plány?